川が絶滅寸前です！

＞でも、川→水路→田んぼへと魚、カニが遡上し、モグラが畔にトンネルを掘り、
　 ザリガニが畔に巣を作るのは米作りにはうれしくない環境です。

確かに農家の方々にとってはそうなのでしょうか。
稲作のご経験のあるやまサンが仰ると大変説得力がありますが・・・

＞実際には、土地改良が行われ、物理的に遡上ができなくなる前に
　 彼らは農薬によって田んぼから駆逐されました。

そうか・・・農薬が先立ったんですね。
この辺の事は以前♯３１２のnntt00_99xyzから現場の貴重なお話がありました。
http://messages.yahoo.co.jp/bbs?.mm=GN&action=m&board=1834578&tid=c0na4acc0dlgc0a3a0a4ga49a1aa&sid=1834578&mid=312

私は、効率的な生産量増加のために農薬に期待するのにも限界があると思うのです。
以前農薬の話題で盛り上がった時
「ウチで食べる分は農家の方が自分の所で食べる無（低）農薬のを分けてもらっている」
と書きましたが、田んぼと共に生きて来た身近な生きもの達が生息できないような環境で
栽培し収穫したお米を口にしている状態というのはどう考えても普通じゃないですよね。
彼らの存在は決して単なる「邪魔者」ではないと思います。
現在は農薬散布の技術や方法も進歩しているし、
食の安全性を考えれば一種のバロメータ（？）的存在ではないでしょうか。
効率化を優先せず、農薬に過度に頼る栽培方法ではない稲作をする農家の方は
今後増えていくと思います。それが最近の消費者の傾向でもありますし。
個人的にはそういった生きもの達が棲む田んぼで健康的に育ったお米を食べたいな。