韓国ふざけんな

＞日本の不統一を強調するのに12世紀まで遡らなくてはいけないというのは？

おそらくは日本人の多くがたぶん無意識に感じている単一民族国家観は幻想にすぎない、ということです。

＞世界との比較の中で、かえって日本人の相対的な均質性を証明してるんじゃないのでしょうか

「相対的」にどうかはよくわかりませんが、このような発言は、たとえ無意識にでも、少数民族への抑圧となりかねません。「均質」であることがすばらしいことでもないし、それはむしろ日本中央権力によるマイノリティへの強制的な同化弾圧を示唆します。
本多勝一は、朝日新聞（北海道版1972年6月25日）にこう書いています。

アイヌ民族の平取町議・貝沢正氏（初代館長）が、開会式で述べた経過報告の中に次のようなことばがあたった。
「開道100年の祝賀は和人の功績のみをたたえ、長い歴史のアイヌの遺徳を無視・抹殺した」「すべてアイヌのものだった北海道の土地が天皇の名によって和人に略奪されていった歴史」「300年の卑屈と劣等感の歴史を、これから追放するための拠点としたい」 　 『先住民族アイヌの現在』所収
（注・「開会式」とは「二風谷アイヌ文化資料館」のそれを指す）

＞日本だけ、それも暗い面だけ強調するのはどうなのかと思うんですが

いえ、ただ天皇との関係性を問うただけです。