南京大虐殺・従軍慰安婦強制連行は事実

関係ないかもしれないけど。
一定レベル以上の研究成果であれば学位はもらえるのではないでしょうか。

中身が自分の主義主張に合わないから認めないというのは、そのような意味においては差別といわれるのでは？

少なくとも日本は思想統制は行われていませんから、気に入らないから「ばか」というのは暴言ではないでしょうか。
説得力のある意見を述べれば罵倒は必要ないはずですから。