さあ！諸君！捕鯨問題だ！

>それに、捕鯨再開の論拠になっているミンクが増えたのはどうしてなんですか？
>他の種が減少したのにたいして。

シロナガス、ナガスの乱獲が原因と考えられます。
餌となるナンキョクオキアミが余剰となり、栄養状態の良くなったミンクの性成熟年齢の低下、毎年出産可能となったこと、などにより増加に加速がついたのです。ペンギン、アザラシなどオキアミを食べる他の生物も増えたのでますますシロナガスの回復が妨げられていると考えられます。これは遠洋水産研究所の加藤秀弘さんが解明、立証したことで有名ですね。
現在の日本政府の方針は自然環境の有効利用「持続的生産可能な野生生物の利用」のためにミンクを獲ろうということですが、貴方の言うように自然環境の回復というためにはミンクやペンギンを途方もない個体数、間引かなくてはならないでしょうね。
ですから現在は初期資源量の推定からのＭＳＹの見極めというよりも「現在の南極海の資源動態モデルの解明」そして「持続的利用」を目指しているということ。