イラクで日本人拘束

＞政府としては日本でテロリストが日本人を誘拐したのと同じ。

全く違うと思いますが、
政府は、日本国内において日本国民の生命・財産を守る義務があります。

また、海外においても同等の義務があるとするとしましょう

しかし、

現在イラクは法人の渡航を遠慮するように
言い換えれば、滞在すれば命の保証は出来ませんよ、といっているところです。