イラクで日本人拘束

＞日本国憲法は政教分離を明確に謳ってます。
神道が国教だったのは悪しき明治憲法時代まで。

個々人の信仰の自由が確保されるのであれば、国教は条文において明示的にせよ暗黙的にせよあっても構わないと思いますが。
現に、正月には多くの人が初詣に行きますよね？
憲法とは、絶対不変の不磨の大典ではありません。
むしろ、時代にそぐわなかったりしてかえって弊害が出てくるようであるのであれば、いつまでも変えないのはむしろまずいと思います。

そして、失礼ながら悪しき明治憲法時代というのも、明治時代・大正時代の歴史をよく学んでおられないことが見てとれます。
大正デモクラシーなど、一定の成果を上げてきました、民主化の進み具合の上でも。普通選挙法が導入されたり。
今の基準を適用して、当時は遅れているとばかり考えるのは誤っています。
なぜ昭和初期の暗黒の時代に入ったのかは、また別に考えなければなりませんが、その時代のことだけを取り上げて「悪しき」というのは短絡的だと思います。