イラクで日本人拘束

＞政教分離原則とは、まったく逆の国なのですね、イランは。

ある意味で、世界的にみても、全く別な政治手法をとった国でもあるみたいです。

ソ連という敵をなくしてしまったアメリカ軍部からみると、脅威の国かもしれません。

＞ハタミ大統領が最高指導者だと思っていたのですが

中東で最高指導者という表現をされるときは「宗教的指導者のトップ」という
意味合いが強いような気がします。

ハメネイ師は宗教的に最も地位が高いのでしょう（たぶん）

政治的実権をもっているのはハタミ大統領です。

ハメネイ師とハタミ大統領との関係がどうなのか私にはよくわかりません。

もしかして天皇制のもとの旧日本政府のようなものかもしれませんし。
政教分離ではないのかどうかは私にはわかりません。

ただ、イラク国内の問題に関してのみ言えば
ハメネイ師の方が多少の影響力があるような気がします。