イラクで日本人拘束

なるほど、土地によって色々違うんですね。
推測ですが何らかの理由で当時の文部省が指導要領からカットしたのではないでしょうか。自分にはわかりません。
ただ国歌・国旗の意味を理解することは重要だと思いますし、一応決まったからには歌詞ぐらいは覚えておくのも重要かなと僕は思いますが。（このへんは法律上は本人の意思を尊重することになっていると思いますが）