日本は何故、反省しないのか？

>ゲリラ船の搭乗員の命には配慮するが、日本の海上保安庁や自衛隊の乗組員の命は無視だな。

どんな立場の人であっても人命は尊いです。
海上保安庁や自衛隊の乗組員の命ももちろん尊いです。

だから撃沈するより、捕まえるほうが良いと言っているのです。

＞武装してる相手を拿捕するのは撃沈させるより日本側の乗員の命の危険がアップするとは理解出来ないのかい？

其のときの状況によるでしょう。
正統防衛は認められますから
危ないと思えば撃沈することは許されます。
できるだけ拿捕する方向で行う
危険を感じれば撃沈するのが最善だと考えます。

＞君は不法行為を繰り返す敵国の戦闘員に対しては配慮するが日本人の命は軽視しているね。

そんなことは言っていません。
国籍に関わらず、人の命は尊いと言っているのです。