日韓歴史論争

＞ー南下してきた「扶余と倭」との混血民が百済を建国した
ー南下してきた扶余と「倭との混血民」が百済を建国した
どちらでしょうか、

血統的には後者で政治的には前者であろうと思われます。

＞扶余は度々南下して来た。しかも同一民族の扶余ではなく既に他民族と混血していた扶余が西南と東南に別時代に南下したら、その時代が離れていれば同じ扶余でも大きく異なってくるのではないでしょうか。

扶余の南下の時代的経緯については専門書をお調べ下さい。
文化的言語的同一性・通話性が無ければ、定義上同一民族ではありませんから、「扶余族」としての言語系統等の同一性は保たれていたと思います。
勿論血統的には原住民とのものを含め混血は当然でしょう。