日韓歴史論争

当時の皇室は一代ごとに異なった宮殿を有しており（一代で二つの宮殿を持つケースもあり）、多くの場合地名を含んだ名称をつけられています。
（honkytonk_2002_xさんも指摘しています。）
百済宮もそういった例に過ぎず、しかも平城京の制定まで50を超える宮殿が存在するようです。
なによりも舒明天皇が百済宮で政務を執ったのはほんの1年（在位期間は12年）皇極天皇の服喪の機関を含めても3年以下しかすんでいなかった百済宮が豪華な宮廷であったといわれても事実ではないでしょうね
（また、百済宮については百済から王子が質として贈られたことを記念する意味もあったかもしれません。）