さあ！諸君！捕鯨問題だ！

あれ、モンク先生がアップされていた大隈先生の記事に、
確かＧＰＳを使って調査を行った事例が紹介されていたと思いますが。
ただ、発信機の機材が高く、コスト的に問題なのと、
発信機が正常に機能するように命中させるのが難しいという事で、
普及するには現状ではまだ問題があるという事だったように記憶しています。

潜水している場合であれば、ご指摘の通り電波を捉えるのは難しいでしょうね。
電波が受信できるのは、呼吸や捕食のために海面付近にいる場合だけのように思います。
逆にそのあたりから、行動の一部が分かるのかも知れませんが。
何れにしろ、現状では難しいということだと思います。