対米全面テロ

＞現在の世界でＣＩＡ以上の諜報機関があるだろうか？

過去のテロ支援のつけで、かなり規模を小さくしたと聞いていますが。
（御存じだと思いますが、アメリカは有数のテロ支援国家です）

＞そんな単純なことをアメリカが知らないわけがない。

作戦に関わった人間が、少なかったらどうでしょう。
ハイジャックしてぶつけるだけですから、十数人も入れば事足ります。
本隊から孤立して行動してれば、情報もれは先ずないと思います。