対米全面テロ

＞改憲派の人達は、現状に合わせて９条を変えようということのようですが、軍隊の指揮権は誰がもつのか、は９条の規定ではないと思うし、結局全部いじることになりますよね。

そうです。現状の国際社会で生き抜けるように改正すべきだと思います。
とれと私は「軍隊」などとは一言も言っていません。「自衛隊」の役割を今までのようになし崩し的な拡大解釈ではなく、憲法で明文化したほうが良いのではといっているのです。
指揮権は現状の憲法では日本が「軍（自衛隊）」を持つことは無いという前提なので当然指揮権などの条項はあろうはずもありません。
それなら、（必要ならば）条項に盛り込めばいいのでは？

＞その場合の、国家としての理念なんかは何かすでに書かれたものがあるんですか

国家としての理念はあくまで、日本国憲法の「前文」です。

＞反安保でアメリカ追随をやめるんなら、アジア集団安保をアメリカ抜きでやるんですか。

？？？、私は反安保だなどと一言たりとも言っていませんが？
人の発言を勝手に捏造しないでください。
私は、日米安保を維持しつつ、今回のような有事に自衛隊で対応できるようにするべきではと考えています。
米国追随ではなく、協力していければとは思っていますけどね。