対米全面テロ

> ハイジャックされたときは、機上では操縦不能にして、地上からのみコントロール出来るようななシステムに出来ないでしょうか。

無理だと思います。

極端な話、地上でコントロールする基地を特殊部隊で強襲され占拠されたら、すべての飛行機が危機に陥ります。